Oct4

Oct4
已知的結構
PDB直系同源搜索: PDBe RCSB
PDBID列表

1OCP、​3L1P

識別號
别名POU5F1;, OCT3, OCT4, OTF-3, OTF3, OTF4, Oct-3, Oct-4, POU class 5 homeobox 1, Oct3/4
外部IDOMIM:164177 MGI:101893 HomoloGene:8422 GeneCards:POU5F1
相關疾病
史蒂芬斯-強森症候群[1]
基因位置(人类
6號染色體
染色体6號染色體[2]
6號染色體
Oct4的基因位置
Oct4的基因位置
基因座6p21.33起始31,164,337 bp[2]
终止31,180,731 bp[2]
基因位置(小鼠
小鼠17号染色体
染色体小鼠17号染色体[3]
小鼠17号染色体
Oct4的基因位置
Oct4的基因位置
基因座17 B1|17 18.69 cM起始35,816,915 bp[3]
终止35,821,669 bp[3]
RNA表达模式




查阅更多表达数据
基因本體
分子功能 DNA结合
sequence-specific DNA binding
miRNA binding
DNA结合转录因子活性
转录因子结合
transcription cis-regulatory region binding
血浆蛋白结合
DNA结合转录阻遏物活性,RNA聚合酶II特异性
DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
泛素蛋白连接酶结合
RNA binding
細胞組分 細胞質
细胞质基质
轉錄調節複合物
核质
细胞核
線粒體
生物學過程 regulation of transcription, DNA-templated
somatic stem cell population maintenance
negative regulation of gene silencing by miRNA
cell fate commitment involved in formation of primary germ layer
endodermal cell fate specification
anatomical structure morphogenesis
mRNA transcription by RNA polymerase II
regulation of asymmetric cell division
negative regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription by RNA polymerase II
transcription, DNA-templated
regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin assembly
multicellular organism development
cardiac cell fate determination
response to wounding
BMP signaling pathway involved in heart induction
基因調節
regulation of heart induction by regulation of canonical Wnt signaling pathway
blastocyst development
positive regulation of transcription by RNA polymerase II
positive regulation of SMAD protein signal transduction
Sources:Amigo / QuickGO
直系同源
物種人類小鼠
Entrez

5460

18999

Ensembl
ENSG00000230336
​ENSG00000206454
​ENSG00000204531
​ENSG00000237582
​ENSG00000229094

​ENSG00000233911
​ENSG00000235068

ENSMUSG00000024406

UniProt

Q01860

P20263

mRNA​序列

NM_203289
​NM_001173531
​NM_001285986
​NM_001285987
​NM_002701

NM_001252452
​NM_013633

蛋白序列
NP_001167002
​NP_001272915
​NP_001272916
​NP_002692
​NP_976034

NP_001272915.1

NP_001239381
​NP_038661

基因位置​(UCSC)Chr 6: 31.16 – 31.18 MbChr 17: 35.82 – 35.82 Mb
PubMed​查找[4][5]
維基數據
檢視/編輯人類檢視/編輯小鼠

Oct4(八聚體結合轉錄因子4, octamer-binding transcription factor 4),亦稱爲POU5F1(第五類POU結構域轉錄因子1),是一種蛋白質,在人體中由POU5F1基因編碼[6]。Oct4是一種具有與POU結構域英语POU domain同源的結構域的轉錄因子。Oct4對未分化的胚胎幹細胞的自我更新與幹性維持至關重要[7]。也正因如此,有時Oct4會被用來作標記未分化細胞的分子標記。Oct4的過表達或低表達都會造成細胞的分化,因此Oct4只在特定的表達強度下才能維持細胞的幹性[8]

Oct4(八聚體結合轉錄因子4)名稱中的「八聚體」(octamer)指DNA核苷酸序列「ATTTGCAT」[9]

參見

參考

  1. ^ 與Oct4相關的疾病;在維基數據上查看/編輯參考. 
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拓展閱讀

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  • Feldman N, Gerson A, Fang J, Li E, Zhang Y, Shinkai Y, Cedar H, Bergman Y. G9a-mediated irreversible epigenetic inactivation of Oct-3/4 during early embryogenesis. Nature Cell Biology. Feb 2006, 8 (2): 188–94. PMID 16415856. doi:10.1038/ncb1353. 
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外部連結

 
(1) 碱性结构域
(1.1)碱性亮氨酸拉链
bZIP英语bZIP domain
转录激活因子英语Activating transcription factorAATF英语Apoptosis-antagonizing transcription factor1、2、3、4、5、6、7) · AP-1(c-Fos、FOSB、FOSL1、FOSL2、c-Jun、JUNB、JUND) · BACH(1、2) · BATF · BLZF1 ·
C/EBPαβγδ、ε、ζ) · CREB(1、3、L1) · CREM · DBP · DDIT3 · GABPA · Gcn4 · HLF · MAF(B、F、G、K) ·
NFE(2、L1、L2、L3) · NFIL3 · NRL · NRF(1、2、3) · XBP1
(1.2)碱性螺旋-环-螺旋
bHLH
ATOH1 · AhR · AHRR · ARNT · ASCL1 · BHLHB2 · BMAL(ARNTL、ARNTL2) · CLOCK · EPAS1 · HAND(1、2) · HES(5、6) ·
HEY(1、2、L) · HES1 · HIF(1A、3A) · ID(1、2、3、4) · LYL1 · MXD4 · MYCL1 · MYCN · Neurogenins(1、2、3 ·
肌形成调节因子英语Myogenic regulatory factors(MyoD、成肌蛋白、MYF5、MYF6) · NeuroD(1、2) · NPAS(1、2、3) · OLIG(1、2) · Pho4 ·
Scleraxis · TAL(1、2) · Twist · USF1
(1.3)bHLH-ZIP英语Basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factors
AP-4 · MAX · MITF · MNT · MLX · MXI1 · Myc · SREBP(1、2)
(1.4) NF-1
NFI(A、B、C、X) · SMAD(R-SMAD(1、2、3、5、9) - I-SMAD(6、7) - 4)
(1.5) RF-X
RFX(1、2、3、4、5、ANK)
(1.6)碱性螺旋-跨-螺旋英语Basic helix-span-helix
(bHSH)
AP-2(α、β、γ、δ、ε)
 
(2) 锌指结构DNA作用区域
(2.1) 核受体Cys4
第一亚族:甲状腺激素受体αβ)、CAR、FXRLXR(α、β)、PPARα英语Peroxisome proliferator-activated receptor alpha、β/δ、γ)、PXR、RAR(α、β、γ)、ROR(α、β、γ)、
Rev-ErbA(α、β)、VDR
第二亚族(COUP-TF(I、II)、Ear-2英语V-erbA-related geneHNF4英语Hepatocyte nuclear factor 4(α、γ)、PNR、RXR(α、β、γ)、Testicular receptor(2、4)、TLX)
第三亚族(甾类激素英语Steroid hormone receptor雄激素、雌激素(α、β)、糖皮质激素、盐皮质激素、孕酮)、雌激素相关英语Estrogen related receptor(α、β、γ))
第四亚族NUR英语Nur (biology)(NGFIB、NOR1、NURR1) · 第五亚族LRH-1、SF1 · 第六亚族GCNF英语Germ cell nuclear factor · 第零亚族DAX1、SHP英语Small heterodimer partner
(2.2) 其他的Cys4结构
GATA英语GATA transcription factor(1、2、3、4、5、6) · MTA(1、2、3) · TRPS1英语Tricho-rhino-phalangeal syndrome Type 1
(2.3) Cys2His2
通用转录因子(TFⅡA、TFⅡB、TFIID、TFⅡE、TFⅡF(1、2)、TFⅡH(1、2、4、2I、3A、3C1、3C2))
ATBF1 · BCL(6、11A、11B) · CTCF · E4F1 · EGR(1、234 · ERV3 · GFI1 · GLI-Krüppel family(1、2、3、REST、S2、YY1) ·
HIC(1、2) · HIVEP(1、2、3) · IKZF(1、2、3) · ILF(2、3) · Sp/KLF家族KLF:1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、17,SP:1、2、4、7、8 · MTF1 · MYT1 ·
OSR1 ·  · WT1 · Zbtb7(7A、7B) · ZBTB(16、17、20、32、33、40) · zinc finger(3、7、9、10、19、22、24、33B、
34、35、41、43、44、51、74、143、146、148、165、202、217、219、238、239、259、267、268、281、295、318、330、346、350、365、366、384、
423、451、452、471、593、638、649、655)
(2.4) Cys6
HIVEP1
(2.5)交替composition
AIRE · DIDO1 · GRLF1 · ING(1、2、4) · JARID(1A、1B、1C、1D、2) · JMJD1B
(2.6)WRKY结构
WRKY转录因子家族英语WRKY transcription factor family
 
(3)螺旋-转角-螺旋结构域
ARX英语Aristaless related homeobox · CDX1、2) · CRX · CUTL1 · DBX(1、2)  · DLX(3、4、5) · EMX2 · EN(1、2) · FHL(1、2、3) · HESX1 · HHEX · HLX · 同源框(A1、A2、A3、A4、A5、A7、A9、A10、A11、A13、B1、B2、B3、B4、B5、B6、B7、B8、B9、B13、C4、C5、C6、C8、C9、C10、C11、C13、D1、D3、D4、D8、D9、D10、D11、
D12、D13) · HOPX · IRX(1、2、3、4、5、6、MKX) · LMX(1A、1B) · MEIS(1、2) · MEOX2 · MNX1 · MSX1、2) · NANOG · NKX(2-1、2-2、2-3、2-5、3-1、3-2、6-1、6-2) · PBX(1、2、3) · PHF(1、3、6、8、10、16、17、20、21A) · PITX(1、2、3) · POU结构域(PIT-1、BRN-3: A、B、C、八聚体转录因子:1、2、3/4、6、7、11) · OTX(1、2) · PDX1 · ZEB1、2)
(3.2)配对框
PAX(1、2、3、4、5、6、7、8、9)
(3.3)叉头状/翼状螺旋
E2F1、2、3、4、5) · FOX proteins(C1、C2、D3、E1、G1、H1、K2、L2、M1、N3、O1、O3、O4、P1、P2P3
(3.4)热休克因子英语Heat Shock Factor
HSF(1、2、4)
(3.5)色氨酸簇英语Tryptophan clusters
ELF(2、4、5) · EGF · ELK(1、3、4) · ERF · ERG · ETS(1、2、SPIB) · ETV(1、4、5、6) · FLI1 · Interferon regulatory factors(1、2、3、4、5、6、7、8) · MYB · MYBL2
(3.6)TEA结构域
transcriptional enhancer factor(1、2、3、4)
 
(4) 具有小凹槽触点的β-支架因子
(4.1) Rel homology region英语Rel homology domain
NF-κB(NFKB1、NFKB2、REL、RELA、RELB) · NFAT(C1、C2、C3、C4、5)
(4.2) STAT
STAT1234、5、6
(4.3) p53样转录因子
p53 p63 p73家族p53 · p63 · p73 · TBX(1、2、3、5、19、21、22、Brachyury、TBR1)
(4.4) MADS盒
Mef2(A、B、C、D) · SRF
(4.7) 高迁移率族
BBX英语BBX (gene) · HMGB1英语HMGB12英语HMGB23英语HMGB34英语HMGB4 · HMGN英语HMGN、(1英语HMGN12英语HMGN23英语HMGN34英语HMGN4 · HNF(1A、1B) · SOX(1、2、3、4、5、6、8、9、10、11、12、13、14、15、18、21、SRY · SSRP1 ·
TCF/LEF家族TCF(1、3、4) · LEF1) · TOX(1、2、3、4)
(4.9) Grainyhead英语Grainyhead
TFCP2
(4.10) 冷休克域英语Cold-shock domain
CSDA、YBX1
(4.11) Runt
CBF(CBFA2T2、CBFA2T3、RUNX1、RUNX2、RUNX3、RUNX1T1)
 
(0) 其他转录因子
(0.2) HMGI(Y)
HMGA(1、2) · HBP1
(0.3) 袋状结构域
Rb · RBL1英语Retinoblastoma-like protein 1 · RBL2英语Retinoblastoma-like protein 2
(0.5) AP-2/EREBP-related factors
Apetala 2 · EREBP英语Ethylene-responsive element binding protein · B3(ARF · ABI3 · RAV)
(0.6) Miscellaneous
ARID(1A、1B、2、3A、3B、4A) · CAP · IFI(16、35) · MLL(2、3、T1) · MNDA · NFY(A、B、C) · ρ因子/σ因子
参见 转录因子/共调节因子缺陷英语Template:Transcription factor/coregulator deficiencies
Category:蛋白质生物合成模板