KLF4

KLF4
已知的結構
PDB直系同源搜索: PDBe RCSB
PDBID列表

2WBS、​2WBU、​4M9E

識別號
别名KLF4;, EZF, GKLF, Kruppel-like factor 4 (gut), Kruppel like factor 4
外部IDOMIM:602253 MGI:1342287 HomoloGene:3123 GeneCards:KLF4
基因位置(人类
9號染色體
染色体9號染色體[1]
9號染色體
KLF4的基因位置
KLF4的基因位置
基因座9q31.2起始107,484,852 bp[1]
终止107,490,482 bp[1]
基因位置(小鼠
小鼠4号染色体
染色体小鼠4号染色体[2]
小鼠4号染色体
KLF4的基因位置
KLF4的基因位置
基因座4 B3|4 29.76 cM起始55,527,143 bp[2]
终止55,532,466 bp[2]
RNA表达模式


查阅更多表达数据
基因本體
分子功能 DNA结合
sequence-specific DNA binding
beta-catenin binding
phosphatidylinositol 3-kinase regulator activity
DNA结合转录因子活性
鋅離子結合
DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
转录因子结合
核心启动子近端区域序列特异性DNA结合
金屬離子結合
RNA polymerase II sequence-specific DNA-binding transcription factor recruiting activity
血浆蛋白结合
nucleic acid binding
double-stranded DNA binding
promoter-specific chromatin binding
RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
transcription coregulator binding
histone deacetylase binding
細胞組分 細胞質
轉錄調節複合物
核质
染色质
细胞核
生物學過程 negative regulation of chemokine (C-X-C motif) ligand 2 production
epidermal cell differentiation
cellular response to retinoic acid
negative regulation of protein kinase B signaling
negative regulation of muscle hyperplasia
平滑肌細胞增殖的負調控
positive regulation of protein metabolic process
negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
regulation of axon regeneration
cellular response to peptide
regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of hemoglobin biosynthetic process
response to retinoic acid
somatic stem cell population maintenance
cellular response to laminar fluid shear stress
regulation of transcription by RNA polymerase II
细胞分化
epidermis morphogenesis
positive regulation of nitric oxide biosynthetic process
cellular response to growth factor stimulus
cellular response to organic cyclic compound
post-embryonic hemopoiesis
negative regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription by RNA polymerase II
response to organic substance
negative regulation of gene expression
negative regulation of response to cytokine stimulus
transcription, DNA-templated
negative regulation of DNA-binding transcription factor activity
negative regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling
stem cell population maintenance
negative regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis
positive regulation of gene expression
negative regulation of cell migration
regulation of cell population proliferation
post-embryonic camera-type eye development
regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity
positive regulation of telomerase activity
canonical Wnt signaling pathway
negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade
regulation of cell differentiation
mesodermal cell fate determination
negative regulation of heterotypic cell-cell adhesion
negative regulation of transcription, DNA-templated
negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity
cellular response to cycloheximide
negative regulation of inflammatory response
fat cell differentiation
positive regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of cell population proliferation
cellular response to hydrogen peroxide
negative regulation of leukocyte adhesion to arterial endothelial cell
positive regulation of core promoter binding
cellular response to leukemia inhibitory factor
negative regulation of angiogenesis
pri-miRNA transcription by RNA polymerase II
negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle
positive regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of sprouting angiogenesis
Sources:Amigo / QuickGO
直系同源
物種人類小鼠
Entrez

9314

16600

Ensembl

ENSG00000136826

ENSMUSG00000003032

UniProt

O43474

Q60793

mRNA​序列

NM_001314052
​NM_004235

NM_010637

蛋白序列

NP_001300981
​NP_004226

NP_034767

基因位置​(UCSC)Chr 9: 107.48 – 107.49 MbChr 4: 55.53 – 55.53 Mb
PubMed​查找[3][4]
維基數據
檢視/編輯人類檢視/編輯小鼠

Kruppel样因子4(英語:Kruppel-like factor 4,缩写KLF4)或肠富集Krüppel样因子(英語:gut-enriched Krüppel-like factor,缩写GKLF)是锌指转录因子KLF家族的一个成员,后者属于一个较大的SP1英语Sp1 transcription factor样转录因子家族[5][6][7]。KLF4参与細胞增殖细胞分化细胞凋亡体细胞重编程英语Reprogramming的调节。有证据表明KLF4在包括大腸癌在内的一些癌症中是肿瘤抑制基因[8]。与KLF2英语KLF2类似,它在C端有三个C2H2型锌指[6]。它有两个核定位序列指引它定位于细胞核内[9]。在胚胎幹細胞(ESCs)和間充質幹細胞(MSCs)中KLF4是显示多能化的很好标记。

参考

  1. ^ 1.0 1.1 1.2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000136826 - Ensembl, May 2017
  2. ^ 2.0 2.1 2.2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000003032 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  4. ^ Mouse PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  5. ^ Black AR, Black JD, Azizkhan-Clifford J. Sp1 and krüppel-like factor family of transcription factors in cell growth regulation and cancer. Journal of Cellular Physiology. August 2001, 188 (2): 143–60. PMID 11424081. doi:10.1002/jcp.1111. 
  6. ^ 6.0 6.1 Dang DT, Pevsner J, Yang VW. The biology of the mammalian Krüppel-like family of transcription factors. The International Journal of Biochemistry & Cell Biology. November 2000, 32 (11–12): 1103–21. PMC 2754176可免费查阅. PMID 11137451. doi:10.1016/s1357-2725(00)00059-5. 
  7. ^ Kaczynski J, Cook T, Urrutia R. Sp1- and Krüppel-like transcription factors. Genome Biology. 2003, 4 (2): 206. PMC 151296可免费查阅. PMID 12620113. doi:10.1186/gb-2003-4-2-206. 
  8. ^ El-Karim EA, Hagos EG, Ghaleb AM, Yu B, Yang VW. Krüppel-like factor 4 regulates genetic stability in mouse embryonic fibroblasts. Molecular Cancer. August 2013, 12: 89. PMC 3750599可免费查阅. PMID 23919723. doi:10.1186/1476-4598-12-89. 
  9. ^ Shields JM, Yang VW. Two potent nuclear localization signals in the gut-enriched Krüppel-like factor define a subfamily of closely related Krüppel proteins. The Journal of Biological Chemistry. July 1997, 272 (29): 18504–7. PMC 2268085可免费查阅. PMID 9218496. doi:10.1074/jbc.272.29.18504. 

外部链接

 
(1) 碱性结构域
(1.1)碱性亮氨酸拉链
bZIP英语bZIP domain
转录激活因子英语Activating transcription factorAATF英语Apoptosis-antagonizing transcription factor1、2、3、4、5、6、7) · AP-1(c-Fos、FOSB、FOSL1、FOSL2、c-Jun、JUNB、JUND) · BACH(1、2) · BATF · BLZF1 ·
C/EBPαβγδ、ε、ζ) · CREB(1、3、L1) · CREM · DBP · DDIT3 · GABPA · Gcn4 · HLF · MAF(B、F、G、K) ·
NFE(2、L1、L2、L3) · NFIL3 · NRL · NRF(1、2、3) · XBP1
(1.2)碱性螺旋-环-螺旋
bHLH
ATOH1 · AhR · AHRR · ARNT · ASCL1 · BHLHB2 · BMAL(ARNTL、ARNTL2) · CLOCK · EPAS1 · HAND(1、2) · HES(5、6) ·
HEY(1、2、L) · HES1 · HIF(1A、3A) · ID(1、2、3、4) · LYL1 · MXD4 · MYCL1 · MYCN · Neurogenins(1、2、3 ·
肌形成调节因子英语Myogenic regulatory factors(MyoD、成肌蛋白、MYF5、MYF6) · NeuroD(1、2) · NPAS(1、2、3) · OLIG(1、2) · Pho4 ·
Scleraxis · TAL(1、2) · Twist · USF1
(1.3)bHLH-ZIP英语Basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factors
AP-4 · MAX · MITF · MNT · MLX · MXI1 · Myc · SREBP(1、2)
(1.4) NF-1
NFI(A、B、C、X) · SMAD(R-SMAD(1、2、3、5、9) - I-SMAD(6、7) - 4)
(1.5) RF-X
RFX(1、2、3、4、5、ANK)
(1.6)碱性螺旋-跨-螺旋英语Basic helix-span-helix
(bHSH)
AP-2(α、β、γ、δ、ε)
 
(2) 锌指结构DNA作用区域
(2.1) 核受体Cys4
第一亚族:甲状腺激素受体αβ)、CAR、FXRLXR(α、β)、PPARα英语Peroxisome proliferator-activated receptor alpha、β/δ、γ)、PXR、RAR(α、β、γ)、ROR(α、β、γ)、
Rev-ErbA(α、β)、VDR
第二亚族(COUP-TF(I、II)、Ear-2英语V-erbA-related geneHNF4英语Hepatocyte nuclear factor 4(α、γ)、PNR、RXR(α、β、γ)、Testicular receptor(2、4)、TLX)
第三亚族(甾类激素英语Steroid hormone receptor雄激素、雌激素(α、β)、糖皮质激素、盐皮质激素、孕酮)、雌激素相关英语Estrogen related receptor(α、β、γ))
第四亚族NUR英语Nur (biology)(NGFIB、NOR1、NURR1) · 第五亚族LRH-1、SF1 · 第六亚族GCNF英语Germ cell nuclear factor · 第零亚族DAX1、SHP英语Small heterodimer partner
(2.2) 其他的Cys4结构
GATA英语GATA transcription factor(1、2、3、4、5、6) · MTA(1、2、3) · TRPS1英语Tricho-rhino-phalangeal syndrome Type 1
(2.3) Cys2His2
通用转录因子(TFⅡA、TFⅡB、TFIID、TFⅡE、TFⅡF(1、2)、TFⅡH(1、2、4、2I、3A、3C1、3C2))
ATBF1 · BCL(6、11A、11B) · CTCF · E4F1 · EGR(1、234 · ERV3 · GFI1 · GLI-Krüppel family(1、2、3、REST、S2、YY1) ·
HIC(1、2) · HIVEP(1、2、3) · IKZF(1、2、3) · ILF(2、3) · Sp/KLF家族KLF:1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、17,SP:1、2、4、7、8 · MTF1 · MYT1 ·
OSR1 ·  · WT1 · Zbtb7(7A、7B) · ZBTB(16、17、20、32、33、40) · zinc finger(3、7、9、10、19、22、24、33B、
34、35、41、43、44、51、74、143、146、148、165、202、217、219、238、239、259、267、268、281、295、318、330、346、350、365、366、384、
423、451、452、471、593、638、649、655)
(2.4) Cys6
HIVEP1
(2.5)交替composition
AIRE · DIDO1 · GRLF1 · ING(1、2、4) · JARID(1A、1B、1C、1D、2) · JMJD1B
(2.6)WRKY结构
WRKY转录因子家族英语WRKY transcription factor family
 
(3)螺旋-转角-螺旋结构域
ARX英语Aristaless related homeobox · CDX1、2) · CRX · CUTL1 · DBX(1、2)  · DLX(3、4、5) · EMX2 · EN(1、2) · FHL(1、2、3) · HESX1 · HHEX · HLX · 同源框(A1、A2、A3、A4、A5、A7、A9、A10、A11、A13、B1、B2、B3、B4、B5、B6、B7、B8、B9、B13、C4、C5、C6、C8、C9、C10、C11、C13、D1、D3、D4、D8、D9、D10、D11、
D12、D13) · HOPX · IRX(1、2、3、4、5、6、MKX) · LMX(1A、1B) · MEIS(1、2) · MEOX2 · MNX1 · MSX1、2) · NANOG · NKX(2-1、2-2、2-3、2-5、3-1、3-2、6-1、6-2) · PBX(1、2、3) · PHF(1、3、6、8、10、16、17、20、21A) · PITX(1、2、3) · POU结构域(PIT-1、BRN-3: A、B、C、八聚体转录因子:1、2、3/4、6、7、11) · OTX(1、2) · PDX1 · ZEB1、2)
(3.2)配对框
PAX(1、2、3、4、5、6、7、8、9)
(3.3)叉头状/翼状螺旋
E2F1、2、3、4、5) · FOX proteins(C1、C2、D3、E1、G1、H1、K2、L2、M1、N3、O1、O3、O4、P1、P2P3
(3.4)热休克因子英语Heat Shock Factor
HSF(1、2、4)
(3.5)色氨酸簇英语Tryptophan clusters
ELF(2、4、5) · EGF · ELK(1、3、4) · ERF · ERG · ETS(1、2、SPIB) · ETV(1、4、5、6) · FLI1 · Interferon regulatory factors(1、2、3、4、5、6、7、8) · MYB · MYBL2
(3.6)TEA结构域
transcriptional enhancer factor(1、2、3、4)
 
(4) 具有小凹槽触点的β-支架因子
(4.1) Rel homology region英语Rel homology domain
NF-κB(NFKB1、NFKB2、REL、RELA、RELB) · NFAT(C1、C2、C3、C4、5)
(4.2) STAT
STAT1234、5、6
(4.3) p53样转录因子
p53 p63 p73家族p53 · p63 · p73 · TBX(1、2、3、5、19、21、22、Brachyury、TBR1)
(4.4) MADS盒
Mef2(A、B、C、D) · SRF
(4.7) 高迁移率族
BBX英语BBX (gene) · HMGB1英语HMGB12英语HMGB23英语HMGB34英语HMGB4 · HMGN英语HMGN、(1英语HMGN12英语HMGN23英语HMGN34英语HMGN4 · HNF(1A、1B) · SOX(1、2、3、4、5、6、8、9、10、11、12、13、14、15、18、21、SRY · SSRP1 ·
TCF/LEF家族TCF(1、3、4) · LEF1) · TOX(1、2、3、4)
(4.9) Grainyhead英语Grainyhead
TFCP2
(4.10) 冷休克域英语Cold-shock domain
CSDA、YBX1
(4.11) Runt
CBF(CBFA2T2、CBFA2T3、RUNX1、RUNX2、RUNX3、RUNX1T1)
 
(0) 其他转录因子
(0.2) HMGI(Y)
HMGA(1、2) · HBP1
(0.3) 袋状结构域
Rb · RBL1英语Retinoblastoma-like protein 1 · RBL2英语Retinoblastoma-like protein 2
(0.5) AP-2/EREBP-related factors
Apetala 2 · EREBP英语Ethylene-responsive element binding protein · B3(ARF · ABI3 · RAV)
(0.6) Miscellaneous
ARID(1A、1B、2、3A、3B、4A) · CAP · IFI(16、35) · MLL(2、3、T1) · MNDA · NFY(A、B、C) · ρ因子/σ因子
参见 转录因子/共调节因子缺陷英语Template:Transcription factor/coregulator deficiencies
Category:蛋白质生物合成模板


KLF4引用了美国国家医学图书馆提供的資料,这些資料属于公共领域