KCNN1

Ідентифікатори

Символи

KCNN1, KCa2.1, SK1, SKCA1, hSK1, potassium calcium-activated channel subfamily N member 1

Зовнішні ІД

OMIM: 602982 MGI: 1933993 HomoloGene: 37595 GeneCards: KCNN1

Реагує на сполуку

bicuculline, tetraethylammonium, tubocurarine^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• small conductance calcium-activated potassium channel activity • calcium-activated potassium channel activity • calmodulin binding • protein heterodimerization activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • voltage-gated potassium channel complex • neuronal cell body • клітинна мембрана • мембрана • neuron projection
Біологічний процес	• potassium ion transport • ion transport • potassium ion transmembrane transport • chemical synaptic transmission
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3780


84036

Ensembl


ENSG00000105642


ENSMUSG00000002908

UniProt


Q92952


Q9EQR3

RefSeq (мРНК)


NM_002248


NM_032397

RefSeq (білок)


NP_002239


NP_115773 NP_001350336 NP_001350337

Локус (UCSC)

Хр. 19: 17.95 – 18 Mb

н/д

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KCNN1 (англ. Potassium calcium-activated channel subfamily N member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 543 амінокислот, а молекулярна маса — 59 987^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNSHSYNGSV	GRPLGSGPGA	LGRDPPDPEA	GHPPQPPHSP	GLQVVVAKSE
PARPSPGSPR	GQPQDQDDDE	DDEEDEAGRQ	RASGKPSNVG	HRLGHRRALF
EKRKRLSDYA	LIFGMFGIVV	MVTETELSWG	VYTKESLYSF	ALKCLISLST
AILLGLVVLY	HAREIQLFMV	DNGADDWRIA	MTCERVFLIS	LELAVCAIHP
VPGHYRFTWT	ARLAFTYAPS	VAEADVDVLL	SIPMFLRLYL	LGRVMLLHSK
IFTDASSRSI	GALNKITFNT	RFVMKTLMTI	CPGTVLLVFS	ISSWIIAAWT
VRVCERYHDK	QEVTSNFLGA	MWLISITFLS	IGYGDMVPHT	YCGKGVCLLT
GIMGAGCTAL	VVAVVARKLE	LTKAEKHVHN	FMMDTQLTKR	VKNAAANVLR
ETWLIYKHTR	LVKKPDQARV	RKHQRKFLQA	IHQAQKLRSV	KIEQGKLNDQ
ANTLTDLAKT	QTVMYDLVSE	LHAQHEELEA	RLATLESRLD	ALGASLQALP
GLIAQAIRPP	PPPLPPRPGP	GPQDQAARSS	PCRWTPVAPS	DCG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну. Локалізований у мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Litt M., LaMorticella D., Bond C.T., Adelman J.P. (1999). Gene structure and chromosome mapping of the human small-conductance calcium-activated potassium channel SK1 gene (KCNN1). Cytogenet. Cell Genet. 86: 70—73. PMID 10516439

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Potassium calcium-activated channel subfamily N member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6290 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q92952 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані