CNGA1

Ідентифікатори

Символи

CNGA1, CNCG, CNCG1, CNG-1, CNG1, RCNC1, RCNCa, RCNCalpha, RP49, Cyclic nucleotide-gated channel alpha 1, cyclic nucleotide gated channel alpha 1, cyclic nucleotide gated channel subunit alpha 1

Зовнішні ІД

OMIM: 123825 MGI: 88436 HomoloGene: 55432 GeneCards: CNGA1

Пов'язані генетичні захворювання

пігментний ретиніт, retinitis pigmentosa 49^[1]

Реагує на сполуку

guanosine cyclic 3',5'-phosphate^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • intracellular cyclic nucleotide activated cation channel activity • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • voltage-gated potassium channel activity • cGMP binding • intracellular cAMP-activated cation channel activity • intracellular cGMP-activated cation channel activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • photoreceptor outer segment • integral component of plasma membrane • photoreceptor outer segment membrane
Біологічний процес	• відповідь на стимул • regulation of rhodopsin mediated signaling pathway • regulation of membrane potential • ion transport • cation transmembrane transport • трансмембранний транспорт • зір • rhodopsin mediated signaling pathway • potassium ion transmembrane transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1259


12788

Ensembl


ENSG00000198515


ENSMUSG00000067220

UniProt


P29973


P29974

RefSeq (мРНК)


NM_000087 NM_001142564 NM_001379270


NM_007723

RefSeq (білок)


NP_000078 NP_001136036 NP_001366199 NP_000078.2


NP_031749

Локус (UCSC)

Хр. 4: 47.94 – 48.02 Mb

Хр. 5: 72.76 – 72.8 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CNGA1 (англ. Cyclic nucleotide gated channel alpha 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 690 амінокислот, а молекулярна маса — 79 586^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKLSMKNNII	NTQQSFVTMP	NVIVPDIEKE	IRRMENGACS	SFSEDDDSAS
TSEESENENP	HARGSFSYKS	LRKGGPSQRE	QYLPGAIALF	NVNNSSNKDQ
EPEEKKKKKK	EKKSKSDDKN	ENKNDPEKKK	KKKDKEKKKK	EEKSKDKKEE
EKKEVVVIDP	SGNTYYNWLF	CITLPVMYNW	TMVIARACFD	ELQSDYLEYW
LILDYVSDIV	YLIDMFVRTR	TGYLEQGLLV	KEELKLINKY	KSNLQFKLDV
LSLIPTDLLY	FKLGWNYPEI	RLNRLLRFSR	MFEFFQRTET	RTNYPNIFRI
SNLVMYIVII	IHWNACVFYS	ISKAIGFGND	TWVYPDINDP	EFGRLARKYV
YSLYWSTLTL	TTIGETPPPV	RDSEYVFVVV	DFLIGVLIFA	TIVGNIGSMI
SNMNAARAEF	QARIDAIKQY	MHFRNVSKDM	EKRVIKWFDY	LWTNKKTVDE
KEVLKYLPDK	LRAEIAINVH	LDTLKKVRIF	ADCEAGLLVE	LVLKLQPQVY
SPGDYICKKG	DIGREMYIIK	EGKLAVVADD	GVTQFVVLSD	GSYFGEISIL
NIKGSKAGNR	RTANIKSIGY	SDLFCLSKDD	LMEALTEYPD	AKTMLEEKGK
QILMKDGLLD	LNIANAGSDP	KDLEEKVTRM	EGSVDLLQTR	FARILAEYES
MQQKLKQRLT	KVEKFLKPLI	DTEFSSIEGP	GAESGPIDST

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами. Локалізований у мембрані.

Література

Distler M., Biel M., Flockerzi V., Hofmann F. (1994). Expression of cyclic nucleotide-gated cation channels in non-sensory tissues and cells. Neuropharmacology. 33: 1275—1282. PMID 7532814 DOI:10.1016/0028-3908(94)90027-2

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CNGA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Cyclic nucleotide gated channel subunit alpha 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2148 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, P29973 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані