RAB6C

Ідентифікатори

Символи

RAB6C, WTH3, member RAS oncogene family

Зовнішні ІД

OMIM: 612909 HomoloGene: 108091 GeneCards: RAB6C

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • GTP binding • GO:0006184 GTPase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • центросома • внутрішньоклітинний • цитоскелет • клітинне ядро • центр організації мікротрубочок • гіалоплазма • комплекс Ґольджі
Біологічний процес	• regulation of centrosome duplication • retrograde transport, endosome to Golgi • intra-Golgi vesicle-mediated transport • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • GO:0007067 мітоз • small GTPase mediated signal transduction • intracellular protein transport • Rab protein signal transduction
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


84084


н/д

Ensembl


ENSG00000222014


н/д

UniProt


Q9H0N0


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_032144


н/д

RefSeq (білок)


NP_115520


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 2: 129.98 – 129.98 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

н/д

Вікідані

Див./Ред. для людей

RAB6C (англ. RAB6C, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.^[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 254 амінокислот, а молекулярна маса — 28 355^[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSAGGDFGNP	LRKFKLVFLG	EQSVAKTSLI	TRFRYDSFDN	TYQAIIGIDF
LSKTMYLEDG	TIGLRLWDTA	GQERLRSLIP	RYIRDSAAAV	VVYDITNVNS
FQQTTKWIDD	VRTERGSDVI	ITLVGNRTDL	ADKRQVSVEE	GERKAKGLNV
TFIETRAKAG	YNVKQLFRRV	AAALPGMEST	QDGSREDMSD	IKLEKPQEQT
VSEGGCSCYS	PMSSSTLPQK	PPYSFIDCSV	NIGLNLFPSL	ITFCNSSLLP
VSWR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

Shan J., Yuan L., Budman D.R., Xu H.-P. (2002). WTH3, a new member of the Rab6 gene family, and multidrug resistance. Biochim. Biophys. Acta. 1589: 112—123. PMID 12007787 DOI:10.1016/S0167-4889(02)00164-7
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tian K., Jurukovski V., Yuan L., Shan J., Xu H. (2005). WTH3, which encodes a small G protein, is differentially regulated in multidrug-resistant and sensitive MCF7 cells. Cancer Res. 65: 7421—7428. PMID 16103095 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-05-0658
Tian K., Wang Y., Xu H. (2007). WTH3 is a direct target of the p53 protein. Br. J. Cancer. 96: 1579—1586. PMID 17426708 DOI:10.1038/sj.bjc.6603724
Young J., Menetrey J., Goud B. (2010). RAB6C is a retrogene that encodes a centrosomal protein involved in cell cycle progression. J. Mol. Biol. 397: 69—88. PMID 20064528 DOI:10.1016/j.jmb.2010.01.009

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16525 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9H0N0 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.