| EPHB2 |
|---|
 |
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
|---|
| Список кодів PDB | | 1B4F, 1F0M, 2QBX, 3ZFM | | |
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | EPHB2, Ephb2, Cek5, Drt, ETECK, Erk, Hek5, Nuk, Prkm5, Qek5, Sek3, Tyro5, CAPB, EK5, EPHT3, PCBC, EPH receptor B2, DRT, ERK, BDPLT22 |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 600997 MGI: 99611 HomoloGene: 37925 GeneCards: EPHB2 |
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • transferase activity
• nucleotide binding
• protein kinase activity
• transmembrane-ephrin receptor activity
• kinase activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• identical protein binding
• transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity
• protein tyrosine kinase activity
• signaling receptor binding
• ATP binding
• axon guidance receptor activity
• ephrin receptor activity
• amyloid-beta binding
• signaling receptor activity
• GO:0032403 protein-containing complex binding
|
|---|
| Клітинна компонента | • integral component of membrane
• гіалоплазма
• cell projection
• мембрана
• integral component of plasma membrane
• extracellular region
• аксон
• neuronal cell body
• дендрит (нейробіологія)
• клітинне ядро
• клітинна мембрана
• neuron projection
• receptor complex
• postsynapse
• glutamatergic synapse
• integral component of postsynaptic membrane
• integral component of presynaptic membrane
|
|---|
| Біологічний процес | • positive regulation of synapse assembly
• roof of mouth development
• фосфорилювання
• transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway
• optic nerve morphogenesis
• ephrin receptor signaling pathway
• навчення
• commissural neuron axon guidance
• нейробіологія розвитку
• multicellular organism development
• regulation of axonogenesis
• dendritic spine development
• dendritic spine morphogenesis
• negative regulation of axonogenesis
• protein phosphorylation
• positive regulation of long-term neuronal synaptic plasticity
• regulation of body fluid levels
• inner ear morphogenesis
• Ангіогенез
• GO:0000767 cell morphogenesis
• animal organ morphogenesis
• regulation of neuronal synaptic plasticity
• urogenital system development
• peptidyl-tyrosine phosphorylation
• corpus callosum development
• central nervous system projection neuron axonogenesis
• axonal fasciculation
• camera-type eye morphogenesis
• retinal ganglion cell axon guidance
• axon guidance
• trans-synaptic signaling by trans-synaptic complex, modulating synaptic transmission
• GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation
• learning or memory
• GO:1901313 positive regulation of gene expression
• positive regulation of synaptic plasticity
• negative regulation of Ras protein signal transduction
• regulation of synapse assembly
• negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade
• postsynaptic membrane assembly
• neuron projection retraction
• positive regulation of long-term synaptic potentiation
• positive regulation of protein localization to plasma membrane
• negative regulation of NMDA glutamate receptor activity
• positive regulation of NMDA glutamate receptor activity
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | NM_001309192
NM_001309193
NM_004442
NM_017449 |
| |
|---|
| RefSeq (білок) | | NP_001296121
NP_001296122
NP_004433
NP_059145 |
| |
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 1: 22.71 – 22.92 Mb | Хр. 4: 136.37 – 136.56 Mb |
|---|
| PubMed search | [1] | [2] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
EPHB2 (англ. EPH receptor B2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 055 амінокислот, а молекулярна маса — 117 493[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MALRRLGAAL | | LLLPLLAAVE | | ETLMDSTTAT | | AELGWMVHPP | | SGWEEVSGYD |
| ENMNTIRTYQ | | VCNVFESSQN | | NWLRTKFIRR | | RGAHRIHVEM | | KFSVRDCSSI |
| PSVPGSCKET | | FNLYYYEADF | | DSATKTFPNW | | MENPWVKVDT | | IAADESFSQV |
| DLGGRVMKIN | | TEVRSFGPVS | | RSGFYLAFQD | | YGGCMSLIAV | | RVFYRKCPRI |
| IQNGAIFQET | | LSGAESTSLV | | AARGSCIANA | | EEVDVPIKLY | | CNGDGEWLVP |
| IGRCMCKAGF | | EAVENGTVCR | | GCPSGTFKAN | | QGDEACTHCP | | INSRTTSEGA |
| TNCVCRNGYY | | RADLDPLDMP | | CTTIPSAPQA | | VISSVNETSL | | MLEWTPPRDS |
| GGREDLVYNI | | ICKSCGSGRG | | ACTRCGDNVQ | | YAPRQLGLTE | | PRIYISDLLA |
| HTQYTFEIQA | | VNGVTDQSPF | | SPQFASVNIT | | TNQAAPSAVS | | IMHQVSRTVD |
| SITLSWSQPD | | QPNGVILDYE | | LQYYEKELSE | | YNATAIKSPT | | NTVTVQGLKA |
| GAIYVFQVRA | | RTVAGYGRYS | | GKMYFQTMTE | | AEYQTSIQEK | | LPLIIGSSAA |
| GLVFLIAVVV | | IAIVCNRRGF | | ERADSEYTDK | | LQHYTSGHMT | | PGMKIYIDPF |
| TYEDPNEAVR | | EFAKEIDISC | | VKIEQVIGAG | | EFGEVCSGHL | | KLPGKREIFV |
| AIKTLKSGYT | | EKQRRDFLSE | | ASIMGQFDHP | | NVIHLEGVVT | | KSTPVMIITE |
| FMENGSLDSF | | LRQNDGQFTV | | IQLVGMLRGI | | AAGMKYLADM | | NYVHRDLAAR |
| NILVNSNLVC | | KVSDFGLSRF | | LEDDTSDPTY | | TSALGGKIPI | | RWTAPEAIQY |
| RKFTSASDVW | | SYGIVMWEVM | | SYGERPYWDM | | TNQDVINAIE | | QDYRLPPPMD |
| CPSALHQLML | | DCWQKDRNHR | | PKFGQIVNTL | | DKMIRNPNSL | | KAMAPLSSGI |
| NLPLLDRTIP | | DYTSFNTVDE | | WLEAIKMGQY | | KESFANAGFT | | SFDVVSQMMM |
| EDILRVGVTL | | AGHQKKILNS | | IQVMRAQMNQ | | IQSVEGQPLA | | RRPRATGRTK |
| RCQPRDVTKK | | TCNSNDGKKK | | GMGKKKTDPG | | RGREIQGIFF | | KEDSHKESND |
| CSCGG |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, білків розвитку, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як нейрогенез, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.
Література
- Tang X.X., Pleasure D.E., Brodeur G.M., Ikegaki N. (1998). A variant transcript encoding an isoform of the human protein tyrosine kinase EPHB2 is generated by alternative splicing and alternative use of polyadenylation signals. Oncogene. 17: 521—526. PMID 9696046 DOI:10.1038/sj.onc.1201960
- Thanos C.D., Goodwill K.E., Bowie J.U. (1999). Oligomeric structure of the human EphB2 receptor SAM domain. Science. 283: 833—836. PMID 9933164 DOI:10.1126/science.283.5403.833
- Chan J., Watt V.M. (1991). eek and erk, new members of the eph subclass of receptor protein-tyrosine kinases. Oncogene. 6: 1057—1061. PMID 1648701
- Unified nomenclature for Eph family receptors and their ligands, the ephrins. Cell. 90: 403—404. 1997. PMID 9267020
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3393 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P29323 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
| На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
