CDK5R1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1H4L, 1UNG, 1UNH, 1UNL, 3O0G

Ідентифікатори

Символи

CDK5R1, CDK5P35, CDK5R, NCK5A, p23, p25, p35, p35nck5a, cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 1 (p35), cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1

Зовнішні ІД

OMIM: 603460 MGI: 101764 HomoloGene: 31200 GeneCards: CDK5R1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein kinase activity • calcium ion binding • ephrin receptor binding • cadherin binding • GO:0016534 cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activator activity • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • protein serine/threonine kinase activator activity • protease binding • actin binding • ionotropic glutamate receptor binding • alpha-tubulin binding • beta-tubulin binding • actin filament binding • protein kinase activator activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • внутрішньоклітинна мембранна органела • growth cone • neuromuscular junction • dendritic spine • аксон • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • protein kinase 5 complex • perinuclear region of cytoplasm • contractile fiber • клітинне ядро • нуклеоплазма • клітинна мембрана • мікротрубочка • neuron projection • presynapse
Біологічний процес	• positive regulation of protein kinase activity • regulation of neuron differentiation • G protein-coupled acetylcholine receptor signaling pathway • regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • regulation of actin cytoskeleton organization • embryo development • ритмічний процес • ephrin receptor signaling pathway • neuron cell-cell adhesion • regulation of microtubule cytoskeleton organization • neuron migration • cerebellum development • positive regulation of protein serine/threonine kinase activity • positive regulation of neuron apoptotic process • brain development • ionotropic glutamate receptor signaling pathway • layer formation in cerebral cortex • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation • neuron differentiation • проліферація • peptidyl-threonine phosphorylation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • neuron projection development • cerebral cortex radially oriented cell migration • axonal fasciculation • hippocampus development • negative regulation of axon extension • regulation of dendritic spine morphogenesis • regulation of macroautophagy • superior olivary nucleus maturation • positive regulation of protein targeting to membrane • axon guidance • regulation of signal transduction by p53 class mediator • serine phosphorylation of STAT protein • microtubule cytoskeleton organization • embryo development ending in birth or egg hatching • positive regulation of microtubule polymerization • positive regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • regulation of synaptic vesicle cycle • activation of protein kinase activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8851


12569

Ensembl


ENSG00000176749


ENSMUSG00000048895

UniProt


Q15078


P61809

RefSeq (мРНК)


NM_003885


NM_009871

RefSeq (білок)


NP_003876


NP_034001

Локус (UCSC)

Хр. 17: 32.49 – 32.49 Mb

Хр. 11: 80.37 – 80.37 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDK5R1 (англ. Cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 307 амінокислот, а молекулярна маса — 34 060^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGTVLSLSPS	YRKATLFEDG	AATVGHYTAV	QNSKNAKDKN	LKRHSIISVL
PWKRIVAVSA	KKKNSKKVQP	NSSYQNNITH	LNNENLKKSL	SCANLSTFAQ
PPPAQPPAPP	ASQLSGSQTG	GSSSVKKAPH	PAVTSAGTPK	RVIVQASTSE
LLRCLGEFLC	RRCYRLKHLS	PTDPVLWLRS	VDRSLLLQGW	QDQGFITPAN
VVFLYMLCRD	VISSEVGSDH	ELQAVLLTCL	YLSYSYMGNE	ISYPLKPFLV
ESCKEAFWDR	CLSVINLMSS	KMLQINADPH	YFTQVFSDLK	NESGQEDKKR
LLLGLDR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як біологічні ритми. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

Tsai L.-H., Delalle I., Caviness V.S. Jr., Chae T., Harlow E. (1994). p35 is a neural-specific regulatory subunit of cyclin-dependent kinase 5. Nature. 371: 419—423. PMID 8090221 DOI:10.1038/371419a0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kerokoski P., Suuronen T., Salminen A., Soininen H., Pirttilae T. (2002). Influence of phosphorylation of p35, an activator of cyclin-dependent kinase 5 (cdk5), on the proteolysis of p35. Brain Res. Mol. Brain Res. 106: 50—56. PMID 12393264 DOI:10.1016/S0169-328X(02)00409-6

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1775 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q15078 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.