CDH9

Ідентифікатори

Символи

CDH9, cadherin 9

Зовнішні ІД

OMIM: 609974 MGI: 107433 HomoloGene: 9450 GeneCards: CDH9

Пов'язані генетичні захворювання

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • молекулярна функція • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of postsynaptic membrane • integral component of presynaptic membrane • cell surface • catenin complex
Біологічний процес	• адгезія клітин • adherens junction organization • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell adhesion • synapse assembly • synaptic membrane adhesion • cell-cell junction assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell-cell adhesion mediated by cadherin • GO:0000767 cell morphogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1007


12565

Ensembl


ENSG00000113100


ENSMUSG00000025370

UniProt


Q9ULB4


P70407

RefSeq (мРНК)


NM_016279


NM_009869

RefSeq (білок)


NP_057363


NP_033999

Локус (UCSC)

Хр. 5: 26.88 – 27.12 Mb

Хр. 15: 16.73 – 16.86 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDH9 (англ. Cadherin 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 789 амінокислот, а молекулярна маса — 88 689^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRTYHYIPLF	IWTYMFHTVD	TILLQEKPNS	YLSSKKIAGL	TKDDGKMLRR
TKRGWMWNQF	FLLEEYTGTD	TQYVGKLHTD	QDKGDGNLKY	ILTGDGAGSL
FVIDENTGDI	HAAKKLDREE	KSLYILRAKA	IDRKTGRQVE	PESEFIIKIH
DINDNEPKFT	KDLYTASVPE	MSGVGTSVIQ	VTATDADDAN	YGNSAKVVYS
ILQGQPYFSV	DPESGIIKTA	LPDMSRENRE	QYQVVIQAKD	MGGQMGGLSG
TTTVNITLTD	VNNNPPRFPQ	STYQFNSPES	VPLGTHLGRI	KANDPDVGEN
AEMEYSIAEG	DGADMFDVIT	DKDTQEGIIT	VKQNLDFENQ	MLYTLRVDAS
NTHPDPRFLH	LGPFKDTAVV	KISVEDIDEP	PVFTKVSYLI	EVDEDVKEGS
IIGQVTAYDP	DARNNLIKYS	VDRHTDMDRI	FGIHSENGSI	FTLKALDRES
SPWHNITVTA	TEINNPKQSS	HIPVFIRILD	INDHAPEFAM	YYETFVCENA
KPGQLIQTVS	VMDKDDPPRG	HKFFFEPVPE	FTLNPNFTIV	DNKDNTAGIM
TRKDGYSRNK	MSTYLLPILI	FDNDYPIQSS	TGTLTIRVCA	CDNQGNMQSC
TAEALILSAG	LSTGALVAIL	LCVLILLILV	VLFAALKRQR	KKEPLIISKD
DVRDNIVTYN	DEGGGEEDTQ	AFDIGTLRNP	EAREDSKLRR	DVMPETIFQI
RRTVPLWENI	DVQDFIHRRL	KENDADPSAP	PYDSLATYAY	EGNDSIADSL
SSLESLTADC	NQDYDYLSDW	GPRFKKLADM	YGGDDSDRD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Shimoyama Y., Tsujimoto G., Kitajima M., Natori M. (2000). Identification of three human type-II classic cadherins and frequent heterophilic interactions between different subclasses of type-II classic cadherins. Biochem. J. 349: 159—167. PMID 10861224 DOI:10.1042/0264-6021:3490159
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CDH9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1768 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9ULB4 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2016. Процитовано 31 серпня 2017.