Циклін-залежна кіназа 6

CDK6

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1BI7, 1BI8, 1BLX, 1G3N, 1JOW, 1XO2, 2EUF, 2F2C, 3NUP, 3NUX, 4AUA, 4EZ5, 4TTH

Ідентифікатори

Символи

CDK6, MCPH12, PLSTIRE, cyclin-dependent kinase 6, cyclin dependent kinase 6

Зовнішні ІД

OMIM: 603368 MGI: 1277162 HomoloGene: 963 GeneCards: CDK6

Пов'язані генетичні захворювання

ревматоїдний артрит, microcephaly 12, primary, autosomal recessive^[1]

Реагує на сполуку

palbociclib, trilaciclib, palbociclib, Abemaciclib, at-7519, AZD5438, ribociclib^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • protein kinase activity • nucleotide binding • cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • cyclin binding • FBXO family protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • центросома • cell projection • cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex • ruffle • центр організації мікротрубочок • цитоскелет • клітинне ядро • гіалоплазма • нуклеоплазма • cyclin D2-CDK6 complex
Біологічний процес	• диференціація клітин • lateral ventricle development • фосфорилювання • positive regulation of cell-matrix adhesion • positive regulation of fibroblast proliferation • dentate gyrus development • regulation of erythrocyte differentiation • astrocyte development • negative regulation of cell differentiation • response to virus • negative regulation of cell cycle • negative regulation of osteoblast differentiation • generation of neurons • поділ клітини • regulation of cell motility • protein phosphorylation • negative regulation of epithelial cell proliferation • регуляція експресії генів • клітинний цикл • type B pancreatic cell development • negative regulation of myeloid cell differentiation • negative regulation of cellular senescence • gliogenesis • negative regulation of cell population proliferation • negative regulation of monocyte differentiation • GO:0072468 сигнальна трансдукція • regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • regulation of cell population proliferation • cell dedifferentiation • G1/S transition of mitotic cell cycle • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • hematopoietic progenitor cell differentiation • Сигнальний шлях Notch • GO:1901313 positive regulation of gene expression • кровотворення • T cell differentiation in thymus • hematopoietic stem cell differentiation • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1021


12571

Ensembl


ENSG00000105810


ENSMUSG00000040274

UniProt


Q00534


Q64261

RefSeq (мРНК)


NM_001145306 NM_001259


NM_009873

RefSeq (білок)


NP_001138778 NP_001250


NP_034003

Локус (UCSC)

Хр. 7: 92.6 – 92.84 Mb

Хр. 5: 3.39 – 3.58 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDK6 (англ. Cyclin dependent kinase 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 326 амінокислот, а молекулярна маса — 36 938^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEKDGLCRAD	QQYECVAEIG	EGAYGKVFKA	RDLKNGGRFV	ALKRVRVQTG
EEGMPLSTIR	EVAVLRHLET	FEHPNVVRLF	DVCTVSRTDR	ETKLTLVFEH
VDQDLTTYLD	KVPEPGVPTE	TIKDMMFQLL	RGLDFLHSHR	VVHRDLKPQN
ILVTSSGQIK	LADFGLARIY	SFQMALTSVV	VTLWYRAPEV	LLQSSYATPV
DLWSVGCIFA	EMFRRKPLFR	GSSDVDQLGK	ILDVIGLPGE	EDWPRDVALP
RQAFHSKSAQ	PIEKFVTDID	ELGKDLLLKC	LTFNPAKRIS	AYSALSHPYF
QDLERCKENL	DSHLPPSQNT	SELNTA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, диференціація клітин, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, клітинних відростках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Meyerson M., Harlow E. (1994). Identification of G1 kinase activity for cdk6, a novel cyclin D partner. Mol. Cell. Biol. 14: 2077—2086. PMID 8114739 DOI:10.1128/MCB.14.3.2077
Mahony D., Parry D.A., Lees E. (1998). Active cdk6 complexes are predominantly nuclear and represent only a minority of the cdk6 in T cells. Oncogene. 16: 603—611. PMID 9482106 DOI:10.1038/sj.onc.1201570
Matushansky I., Radparvar F., Skoultchi A.I. (2003). CDK6 blocks differentiation: coupling cell proliferation to the block to differentiation in leukemic cells. Oncogene. 22: 4143—4149. PMID 12833137 DOI:10.1038/sj.onc.1206484
Leong W.F., Chow V.T. (2006). Transcriptomic and proteomic analyses of rhabdomyosarcoma cells reveal differential cellular gene expression in response to enterovirus 71 infection. Cell. Microbiol. 8: 565—580. PMID 16548883 DOI:10.1111/j.1462-5822.2005.00644.x
Fujimoto T., Anderson K., Jacobsen S.E., Nishikawa S.I., Nerlov C. (2007). Cdk6 blocks myeloid differentiation by interfering with Runx1 DNA binding and Runx1-C/EBPalpha interaction. EMBO J. 26: 2361—2370. PMID 17431401 DOI:10.1038/sj.emboj.7601675

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CDK6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Cyclin dependent kinase 6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1777 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q00534 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.