ORC3
| Комплекс препознавања места почетка (ORC) подјединица 3 N-terminus | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||
| Simbol | ORC3_N | ||||||||
| Pfam | PF07034 | ||||||||
| InterPro | IPR010748 | ||||||||
| |||||||||
| Kompleks prepoznavanja mesta početka, podjedinica 3 | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификатори | |||||||||||
| Симболи | ORC3; LAT; LATHEO; ORC3L | ||||||||||
| Вањски ИД | OMIM: 604972 MGI: 1354944 HomoloGene: 8225 GeneCards: ORC3 Gene | ||||||||||
| |||||||||||
| Преглед РНК изражавања | |||||||||||
 | |||||||||||
| подаци | |||||||||||
| Ортолози | |||||||||||
| Врста | Човек | Миш | |||||||||
| Ентрез | 23595 | 50793 | |||||||||
| Eнсембл | ENSG00000135336 | ENSMUSG00000040044 | |||||||||
| UниПрот | Q9UBD5 | Q9JK30 | |||||||||
| Реф. Секв. (иРНК) | NM_001197259 | NM_001159563 | |||||||||
| Реф. Секв. (протеин) | NP_001184188 | NP_001153035 | |||||||||
| Локација (УЦСЦ) | Chr 6: 88.3 - 88.38 Mb | Chr 4: 34.57 - 34.61 Mb | |||||||||
| ПубМед претрага | [1] | [2] | |||||||||
Комплекс препознавања места почетка 3 је протеин који је код људи кодиран ORC3 (ORC3L) геном.[1][2][3]
Комплекс препознавања места почетка (ORC) је високо конзервисани протеински комплекс са шест подјединица који је есенцијалан за иницијацију репликације ДНК код еукариотских ћелија. Истраживања на квасцу су показала да се ОРЦ специфично везује за место почетка репликације и да служи као платформа за конструкцију пререпликационог комплекса, који садржи додатне иницијациона факторе као што су Cdc6 и mcm протеини. Протеин кодиран овим геном је подјединица комплекса препознавања места почетка. Студије сличног гена код муве Дросопхила сугеришу да вероватно учествује у неуронској пролиферацији и олфакторној меморији. Алтернативно сплајсоване транскриптне варијанте кодирају дистинктне изоформе.[3]
Интеракције
ORC3 формира интеракције са ORC2,[2][4][5][6][7] MCM7,[4] ORC4,[2][5][7] ORC5,[2][4][5][7] MCM4[4] i ORC6.[4][7]
Референце
- ^ Tugal T, Zou-Yang XH, Gavin K, Pappin D, Canas B, Kobayashi R, Hunt T, Stillman B (јануар 1999). „The Orc4p and Orc5p subunits of the Xenopus and human origin recognition complex are related to Orc1p and Cdc6p”. J Biol Chem. 273 (49): 32421—9. PMID 9829972. doi:10.1074/jbc.273.49.32421.
- ^ а б в г Pinto S, Quintana DG, Smith P, Mihalek RM, Hou ZH, Boynton S, Jones CJ, Hendricks M, Velinzon K, Wohlschlegel JA, Austin RJ, Lane WS, Tully T, Dutta A (јул 1999). „latheo encodes a subunit of the origin recognition complex and disrupts neuronal proliferation and adult olfactory memory when mutant”. Neuron. 23 (1): 45—54. PMID 10402192. doi:10.1016/S0896-6273(00)80752-7.
- ^ а б „Entrez Gene: ORC3L origin recognition complex, subunit 3-like (yeast)”.
- ^ а б в г д Kneissl, Margot; Pütter Vera; et al. (март 2003). „Interaction and assembly of murine pre-replicative complex proteins in yeast and mouse cells”. J. Mol. Biol. England. 327 (1): 111—28. ISSN 0022-2836. PMID 12614612. doi:10.1016/S0022-2836(03)00079-2.
- ^ а б в Dhar, S K; Delmolino L; Dutta A (август 2001). „Architecture of the human origin recognition complex”. J. Biol. Chem. United States. 276 (31): 29067—71. ISSN 0021-9258. PMID 11395502. doi:10.1074/jbc.M103078200.
- ^ Matsuoka, Shuhei; Ballif Bryan A; et al. (мај 2007). „ATM and ATR substrate analysis reveals extensive protein networks responsive to DNA damage”. Science. United States. 316 (5828): 1160—6. PMID 17525332. doi:10.1126/science.1140321.
- ^ а б в г Vashee, S; Simancek P; et al. (јул 2001). „Assembly of the human origin recognition complex”. J. Biol. Chem. United States. 276 (28): 26666—73. ISSN 0021-9258. PMID 11323433. doi:10.1074/jbc.M102493200.
Литература
- Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides”. Gene. 138 (1–2): 171—4. PMID 8125298. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8.
- Suzuki Y; Yoshitomo-Nakagawa K; Maruyama K; et al. (1997). „Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library”. Gene. 200 (1–2): 149—56. PMID 9373149. doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3.
- Springer J; Nanda I; Hoehn K; et al. (2000). „Identification and chromosomal localization of murine ORC3, a new member of the mouse origin recognition complex”. Cytogenet. Cell Genet. 87 (3–4): 245—51. PMID 10702681. doi:10.1159/000015435.
- Thome KC; Dhar SK; Quintana DG; et al. (2001). „Subsets of human origin recognition complex (ORC) subunits are expressed in non-proliferating cells and associate with non-ORC proteins”. J. Biol. Chem. 275 (45): 35233—41. PMID 10954718. doi:10.1074/jbc.M005765200.
- Wiemann S; Weil B; Wellenreuther R; et al. (2001). „Toward a catalog of human genes and proteins: sequencing and analysis of 500 novel complete protein coding human cDNAs”. Genome Res. 11 (3): 422—35. PMC 311072
. PMID 11230166. doi:10.1101/gr.GR1547R. - Vashee S, Simancek P, Challberg MD, Kelly TJ (2001). „Assembly of the human origin recognition complex”. J. Biol. Chem. 276 (28): 26666—73. PMID 11323433. doi:10.1074/jbc.M102493200.
- Dhar SK, Delmolino L, Dutta A (2001). „Architecture of the human origin recognition complex”. J. Biol. Chem. 276 (31): 29067—71. PMID 11395502. doi:10.1074/jbc.M103078200.
- Strausberg RL; Feingold EA; Grouse LH; et al. (2003). „Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899—903. PMC 139241 . PMID 12477932. doi:10.1073/pnas.242603899.
- Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (2003). „Interaction and assembly of murine pre-replicative complex proteins in yeast and mouse cells”. J. Mol. Biol. 327 (1): 111—28. PMID 12614612. doi:10.1016/S0022-2836(03)00079-2.
- Ota T; Suzuki Y; Nishikawa T; et al. (2004). „Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs”. Nat. Genet. 36 (1): 40—5. PMID 14702039. doi:10.1038/ng1285.
- Ramachandran N; Hainsworth E; Bhullar B; et al. (2004). „Self-assembling protein microarrays”. Science. 305 (5680): 86—90. PMID 15232106. doi:10.1126/science.1097639.
- Gerhard DS; Wagner L; Feingold EA; et al. (2004). „The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)”. Genome Res. 14 (10B): 2121—7. PMC 528928 . PMID 15489334. doi:10.1101/gr.2596504.
- Sibani S, Price GB, Zannis-Hadjopoulos M (2005). „Ku80 binds to human replication origins prior to the assembly of the ORC complex”. Biochemistry. 44 (21): 7885—96. PMID 15910003. doi:10.1021/bi047327n.
- Matsuoka S; Ballif BA; Smogorzewska A; et al. (2007). „ATM and ATR substrate analysis reveals extensive protein networks responsive to DNA damage”. Science. 316 (5828): 1160—6. PMID 17525332. doi:10.1126/science.1140321.
- п
- р
- у
и иницијација
| Prokariotska (иницијација) | |
|---|---|
| Еукариотска (припрема у Г1 фази) | Пререпликациони комплекс: Комплекс препознавања места почетка (ORC1, ORC2, ORC3, ORC4, ORC5, ORC6) · Одржавање минихромозома (MCM2 · MCM3 · MCM4 · MCM5 · MCM6 · MCM7) · CDC6 Аутономна репликациона секвенца Протеин једноланчаног везивања (SSBP1, SSBP2, SSBP3, SSBP4) Примаза: PRIM1 · PRIM2 |
| Оба | Почетак репликације/Ori/Репликон Репликациона виљушка (заостајући и водећи ланци) · Оказакијев фрагмент · Прајмер |
| Прокариотска (елонгација) | ДНК полимераза III холоензим (dnaC, dnaE, dnaH, dnaN, dnaQ, dnaT, dnaX, holA, holB, holC, holD, holE) · Реплизом · ДНК лигаза · ДНК стега · Топоизомераза (ДНК гиразa) Прокариотска ДНК полимераза: ДНК полимераза I (Кленов фрагмент) |
|---|---|
| Еукариотска (синтеза у С фази) | |
| Оба | Кретање: Процесивност · ДНК лигаза |
Б бсyн: днк (репл, цyцл, рецо, репр) · тсцр (фацт, тцрг, нуцл, рнат, репт, пттс) · тлтн (рису, пттл, неxн) · днаб, рнаб/рунп · стру (домн, 1°, 2°, 3°, 4°)
